Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
RNF185Q96GF1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms