Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
RNFT2Q96EX2 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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