Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FAM3DQ96BQ1 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FAM3DQ96BQ1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FAM3DQ96BQ1 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FAM3DQ96BQ1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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FAM3DQ96BQ1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM3DQ96BQ1 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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FAM3DQ96BQ1 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
FAM3DQ96BQ1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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