Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HJURPQ8NCD3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms