Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C9

C17orf78, Uncharacterized protein C17orf78, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf78Q8N4C9 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C17orf78Q8N4C9 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms