Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KNDC1Q76NI1 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
KNDC1Q76NI1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms