Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

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Length 1,352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
USP31Q70CQ4 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
USP31Q70CQ4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
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