Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SMARCD3Q6STE5 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SMARCD3Q6STE5 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms