Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C1

SLC25A47, Solute carrier family 25 member 47, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A47Q6Q0C1 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SLC25A47Q6Q0C1 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms