Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
LMOD2Q6P5Q4 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
LMOD2Q6P5Q4 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms