Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTF9

RHBDD2, Rhomboid domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD2Q6NTF9 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
RHBDD2Q6NTF9 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.7 ms