Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT89

TRNP1, TMF-regulated nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRNP1Q6NT89 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TRNP1Q6NT89 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms