Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ATG16L1Q676U5 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms