Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSY0

GKAP1, G kinase-anchoring protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1Q5VSY0 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
GKAP1Q5VSY0 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms