Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Q5VSD8 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Q5VSD8 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q5VSD8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q5VSD8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q5VSD8 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q5VSD8 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q5VSD8 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q5VSD8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q5VSD8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Q5VSD8 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
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