Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
KCNT1Q5JUK3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms