Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PITRM1Q5JRX3 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PITRM1Q5JRX3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms