Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TDRD12Q587J7 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms