Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY46

KRTAP13-3, Keratin-associated protein 13-3, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP13-3Q3SY46 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.81
KRTAP13-3Q3SY46 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
KRTAP13-3Q3SY46 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms