Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI61

KRTAP20-2, Keratin-associated protein 20-2, humanhuman

Predictions only

Length 65 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-2Q3LI61 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
KRTAP20-2Q3LI61 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms