Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CCDC96Q2M329 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms