Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
IMPG1Q17R60 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
IMPG1Q17R60 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
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