Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 BUD23-204ENST00000423497 1219 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 MTND1P6-201ENST00000523621 946 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AL009172.1-201ENST00000436365 1098 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AL035587.1-202ENST00000607218 984 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 MTND2P2-201ENST00000434633 945 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 CTXN3-204ENST00000620385 1208 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AL162390.1-201ENST00000622201 1246 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AL732372.1-203ENST00000635159 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AL035563.1-201ENST00000609087 1539 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 PGM5-AS1-202ENST00000420855 572 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 LINC02434-201ENST00000502419 677 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FOXD1Q16676 AC131902.1-201ENST00000521558 594 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
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