Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
NTRK2Q16620 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms