Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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DDB1Q16531 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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DDB1Q16531 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
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DDB1Q16531 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
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DDB1Q16531 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
DDB1Q16531 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
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