Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
ALX1Q15699 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
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