Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PRKD1Q15139 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PRKD1Q15139 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms