Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
R3HDM1Q15032 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
R3HDM1Q15032 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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