Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
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COL19A1Q14993 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
COL19A1Q14993 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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