Protein–RNA interactions for Protein: Q14406

CSHL1, Chorionic somatomammotropin hormone-like 1, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSHL1Q14406 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CSHL1Q14406 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CSHL1Q14406 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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