Protein–RNA interactions for Protein: Q14031

COL4A6, Collagen alpha-6(IV) chain, humanhuman

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Length 1,691 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A6Q14031 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
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COL4A6Q14031 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
COL4A6Q14031 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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COL4A6Q14031 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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COL4A6Q14031 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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COL4A6Q14031 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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COL4A6Q14031 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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COL4A6Q14031 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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COL4A6Q14031 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL4A6Q14031 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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