Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
KCNC3Q14003 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms