Protein–RNA interactions for Protein: Q13568

IRF5, Interferon regulatory factor 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF5Q13568 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
IRF5Q13568 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
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