Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
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FOXE3Q13461 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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FOXE3Q13461 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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FOXE3Q13461 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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FOXE3Q13461 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXE3Q13461 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXE3Q13461 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXE3Q13461 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXE3Q13461 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXE3Q13461 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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FOXE3Q13461 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXE3Q13461 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXE3Q13461 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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FOXE3Q13461 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
FOXE3Q13461 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
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