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| FOXE3 | Q13461 | AL137026.1-202 | ENST00000452578 | 1089 nt | TSL 2 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SAPCD2P3-201 | ENST00000455031 | 850 nt | BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MYL6-203 | ENST00000536128 | 1221 nt | TSL 2 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC015712.1-203 | ENST00000559331 | 593 nt | TSL 3 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MFSD11-207 | ENST00000586622 | 2952 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CCDC106-206 | ENST00000591241 | 1153 nt | TSL 3 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC011455.1-201 | ENST00000593830 | 504 nt | TSL 3 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PLAUR-214 | ENST00000601723 | 1205 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FLJ13224-201 | ENST00000313737 | 1514 nt | BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PYCR2-208 | ENST00000612039 | 1549 nt | TSL 3 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PYCR2-209 | ENST00000612651 | 1538 nt | TSL 5 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ALDH1A3-201 | ENST00000329841 | 3924 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NOMO2-202 | ENST00000381474 | 3911 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SEPHS1-201 | ENST00000327347 | 3273 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.89 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NIPAL2-201 | ENST00000341166 | 4581 nt | TSL 2 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | REXO1L9P-201 | ENST00000604264 | 2108 nt | BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HTATSF1-204 | ENST00000535601 | 3019 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SLC39A5-201 | ENST00000266980 | 2031 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZBTB47-202 | ENST00000505904 | 2456 nt | TSL 5 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CEP83-AS1-201 | ENST00000623122 | 2482 nt | BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | BTBD1-201 | ENST00000261721 | 3297 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | BPHL-203 | ENST00000380379 | 1928 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | ZBTB9-201 | ENST00000395064 | 2716 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SEH1L-202 | ENST00000399892 | 1846 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CHTOP-203 | ENST00000368690 | 2165 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | FAM237A-203 | ENST00000543490 | 1376 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | STK32A-AS1-201 | ENST00000504297 | 863 nt | TSL 3 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | TMEM218-203 | ENST00000526175 | 972 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AP000721.2-201 | ENST00000537170 | 650 nt | TSL 4 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TRAF7-205 | ENST00000567653 | 666 nt | TSL 2 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | PPP1R1B-208 | ENST00000580825 | 1038 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC114488.2-214 | ENST00000609033 | 813 nt | TSL 5 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AXIN2-208 | ENST00000611991 | 1019 nt | TSL 5 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | HNF1B-206 | ENST00000620125 | 1103 nt | TSL 5 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DSCR9-201 | ENST00000454482 | 1644 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MYO19-225 | ENST00000621344 | 1640 nt | TSL 2 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MIB2-201 | ENST00000355826 | 3290 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC046158.3-201 | ENST00000624947 | 2558 nt | BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | LCAT-201 | ENST00000264005 | 1507 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC126755.2-202 | ENST00000427999 | 1547 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ZBTB11-202 | ENST00000461821 | 2115 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GUCY1B3-206 | ENST00000507146 | 2709 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | ARHGAP27-214 | ENST00000532891 | 2604 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | GPC2-201 | ENST00000292377 | 2532 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | RNF169-201 | ENST00000299563 | 7823 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CERS6-201 | ENST00000305747 | 7217 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | RHOF-201 | ENST00000267205 | 3009 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | FCGRT-202 | ENST00000426395 | 1559 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MIPEP-201 | ENST00000382172 | 2400 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.88 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PYCR3-201 | ENST00000220966 | 2678 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | ARSI-201 | ENST00000328668 | 3161 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ASIC2-201 | ENST00000225823 | 3443 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | DNAJC28-203 | ENST00000402202 | 1480 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MED29-202 | ENST00000594368 | 1471 nt | TSL 2 BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NCCRP1-201 | ENST00000339852 | 1978 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | ATOH1-201 | ENST00000306011 | 2212 nt | APPRIS P1 BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MAPRE3-201 | ENST00000233121 | 1892 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | EN2-201 | ENST00000297375 | 3395 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PORCN-205 | ENST00000367574 | 1368 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PCDHA8-201 | ENST00000378123 | 2616 nt | APPRIS ALT2 BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SULT1A1-204 | ENST00000395609 | 1871 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | MRPL10-203 | ENST00000414011 | 1622 nt | TSL 3 BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PAX4-204 | ENST00000463946 | 1613 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | PORCN-214 | ENST00000537758 | 1371 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SSC5D-202 | ENST00000587166 | 3017 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | NADSYN1-201 | ENST00000319023 | 2773 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | MON1B-202 | ENST00000439557 | 1759 nt | TSL 2 BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TSR2-201 | ENST00000375151 | 1534 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | PRSS38-201 | ENST00000366757 | 1267 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | CD1E-203 | ENST00000368156 | 861 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
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| FOXE3 | Q13461 | AC007967.3-201 | ENST00000434308 | 558 nt | BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | TMEM135-209 | ENST00000532959 | 1149 nt | TSL 2 BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | BMF-207 | ENST00000559701 | 630 nt | TSL 3 BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | COX5A-202 | ENST00000562233 | 441 nt | TSL 3 BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SAXO2-206 | ENST00000566205 | 340 nt | APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC016876.1-204 | ENST00000573187 | 679 nt | TSL 3 BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | SHBG-211 | ENST00000574539 | 938 nt | TSL 1 (best) BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC020934.1-201 | ENST00000588469 | 739 nt | TSL 3 BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |
| FOXE3 | Q13461 | AC010522.1-205 | ENST00000598031 | 606 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 13.87 | □□□□□ -0.19 | | |