Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
TCOF1Q13428 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCOF1Q13428 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCOF1Q13428 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCOF1Q13428 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCOF1Q13428 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCOF1Q13428 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCOF1Q13428 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCOF1Q13428 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TCOF1Q13428 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCOF1Q13428 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TCOF1Q13428 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCOF1Q13428 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCOF1Q13428 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCOF1Q13428 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
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