Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
XRCC4Q13426 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
XRCC4Q13426 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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