Protein–RNA interactions for Protein: Q13351

KLF1, Krueppel-like factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF1Q13351 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
KLF1Q13351 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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