Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ATMQ13315 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ATMQ13315 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ATMQ13315 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ATMQ13315 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms