Protein–RNA interactions for Protein: Q13228

SELENBP1, Selenium-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENBP1Q13228 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SELENBP1Q13228 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SELENBP1Q13228 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms