Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CBX3Q13185 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CBX3Q13185 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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