Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CDC16Q13042 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CDC16Q13042 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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