Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FOXF1Q12946 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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