Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
GRIN2AQ12879 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GRIN2AQ12879 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
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