Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TROQ12816 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TROQ12816 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TROQ12816 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TROQ12816 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TROQ12816 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TROQ12816 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms