Protein–RNA interactions for Protein: Q12772

SREBF2, Sterol regulatory element-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SREBF2Q12772 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SREBF2Q12772 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SREBF2Q12772 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms