Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CCDC15Q0P6D6 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms