Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CALD1Q05682 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CALD1Q05682 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms