Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PTPN12Q05209 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPN12Q05209 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms