Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
ATP7AQ04656 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ATP7AQ04656 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms