Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CACNB1Q02641 RPL35A-206ENST00000464167 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 PLG-203ENST00000366924 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC117944.1-201ENST00000430748 641 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AL356277.3-202ENST00000436672 587 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AL050303.1-201ENST00000444356 458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 KCTD14-202ENST00000533144 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC092354.2-201ENST00000607786 514 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ASNSD1-209ENST00000607829 581 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 FP475955.2-201ENST00000623720 458 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 BACE2-IT1-201ENST00000433378 382 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC105313.1-201ENST00000509121 353 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 NSMCE2-208ENST00000520866 1183 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC021269.1-201ENST00000526860 705 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AL591770.1-201ENST00000554475 1131 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC020978.9-201ENST00000624380 1141 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CACNB1Q02641 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms